Группа 1
- Кубань – Фейеноорд
- Рапид Вена – Дила Гори
- Зюлте Варегем – АПОЭЛ
- Тромсе – Бешикташ
- Пандурий – Брага
Группа 2
- Аполлон – Ницца
- Актобе – Динамо Киев
- Суонси – Петролул
- Атромитос – АЗ
- Хафнарфьордур – Генк
Группа 3
- Эльфсборг – Нордшелланд
- Шленск – Севилья
- Зальцбург – Жальгирис
- Карабах – Айнтрахт
- Минск – Стандард
Группа 4
- Яблонец – Бетис
- Риека – Штутгарт
- Черноморец Одесса – Скендербеу
- Маккаби (Тель-Авив) – ПАОК
- Санкт-Галлен – Спартак
Группа 5
- Рубин – Мельде
- Войводина – Шериф
- Трабзонспор – Кукеси
- Эсбьерг – Сент-Этьен
- Грассхоппер – Фиорентина
Группа 6
- Маккаби Хайфа – Астра
- Удинезе – Слован
- Динамо Тбилиси – Тоттенхэм
- Эшторил – Пашинг
- Нымме Калью – Днепр
- Партизан – Тун
